抗体可变区CDR标注

对抗体可变区进行CDR和FR区域的标注 — 支持IMGT、Kabat、Chothia、Martin编号方案

🔬 CDR 标注工具

对抗体可变区进行CDR和FR区域的标注;选择编号系统(IMGT, Chothia, Kabat, Martin)和标注方案(Chothia, Kabat, IMGT及Contact)。注意:Kabat编号方案与Contact定义方案不兼容

序列长度: 0 aa

📖 抗体可变区注释参考

CDR 定义方案对照表

Kabat定义方案:基于序列可变性(variability),使用最为广泛。

Chothia定义方案:基于结构loop区的位置。

Contact 定义方案:基于抗体复合物晶体结构数据,适用于亲和力改造。

LoopKabatAbM (Martin)ChothiaContactIMGT
L1L24--L34L24--L34L24--L34L30--L36L27--L32
L2L50--L56L50--L56L50--L56L46--L55L50--L51
L3L89--L97L89--L97L89--L97L89--L96L89--L97
H1H31--H35B (Kabat编号)H26--H35BH26--H32..34H30--H35BH26--H35B
H1H31--H35 (Chothia编号)H26--H35H26--H32H30--H35H26--H33
H2H50--H65H50--H58H52--H56H47--H58H51--H56
H3H95--H102H95--H102H95--H102H93--H101H93--H102

注意事项

注1:不同文献中的标注略有不同,特别是Chothia标注方案。

注2:除Contact标注方案使用Chothia或Martin编号方案外,其他标注方案可与各种编号方案兼容。

注3:CDR-H1的Chothia loop末端在使用Kabat编号时,根据loop长度不同位于H32至H34之间(取决于H35A和H35B的存在与否)。

参考资料

👉 abYsis - Antibody Information

👉 IMGT编号系统

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